 |
Tutkimusohjekirjan etusivu. Hakemisto erikoisalan, nimen, lyhenteen tai tutkimusnumeron mukaan
BCR/ABL-geenien fuusio-RNA: t(9:22), kvantitatiivinen, luuytimestä
| 4895 | Bm-BCR-QR |
Tiedustelut
Molekyylibiologian laboratorio, puh. 040 6356318
Asiantuntijat
erikoistuva lääkäri Sanna Koskela: sanna.koskela
nordlab.fi / 0406356284
Lähete
Molekyylibiologia, Nordlab Oulu
Indikaatiot
Pääindikaatio BCR-ABL1-fuusiogeenin jäännöstautianalytiikka, kun potilaalta on tunnistettu diagnoosivaiheen näytteestä BCR-ABL1 Major-tyypin fuusio-RNA:ta.
Esivalmistelu
Näytteen esitiedot lähetetään sähköisen pyynnön yhteydessä tai mikäli ei mahdollista, tarvittaessa paperimuodossa https://www.nordlab.fi/wp-content/uploads/2022/03/molekyylilaboratoriolahete.pdf
Näyteastia
PAXgene TM-putki
Näyte
NÄYTE: 2,5 ml luuydinnäytettä PAXgeneTM-putkeen.
Näytteenotossa tarvitaan 15G*1 avoneula (Neoject). Näyte siirretään suoraan PAXgeneTM-putkeen. Ruisku ilmataan täyteen volyymiin. Laitetaan neula ruiskuun ja käännetään neula-ruiskuyhdistelmä alassuin. Neula painetaan PAXgeneTM-putkeen ja annetaan vakuumin imeä putki täyteen. Mäntää ei saa työntää. Neula-ruiskuyhdistelmä irrotetaan putkesta ja PAXgeneTM-putki sekoitetaan kääntelemällä varovasti ylös alas 8-10 kertaa.
PAXgeneTM-putki on muovinen, steriili vakuumiputki, joka sisältää punasoluja hemolysoivaa ja RNA:ta stabiloivaa nestettä 6,5 ml. Putken näytevolyymi on 2,5 ml. Putki säilytetään huoneenlämmössä. Putkea ei saa avata missään vaiheessa. Putkia voi tilata Näytteen vastaanotosta puh. 040 6356345.
Näyte säilyy huoneenlämmössä 2 vrk ja jääkaapissa 5 vrk kuitenkin niin ettei kokonaissäilytysaika ylitä 5 vrk.
LÄHETYS: Näyte lähetetään huoneenlämpöisenä ja mahdollisimman pian näytteenoton jälkeen. Oltava perillä 2 vrk:n kuluessa
Menetelmä
Kvantitatiivinen reaaliaikainen RT-PCR.
Tekotiheys
Tarvittaessa
Tulokset valmiina
Kuukauden kuluessa
Yleistä
BCR-ABL1-fuusiogeeni liittyy kromosomitranslokaatioon t(9:22), joka havaitaan lähes kaikilla kroonista myelooista leukemiaa (KML) sairastavilla potilailla ja noin 30 %:lla akuuttia lymfaattista leukemiaa sairastavista aikuispotilaista.
Tällä tutkimuksella analysoidaan BCR-ABL1 Major-fuusiogeenin (tyypit b3a2 ja b2a2) transkriptin eli fuusio-RNA:n määrää, joka on osoitettavissa 97-98% KML-potilaista. Negatiivinen tulos ei siten täysin poissulje translokaation (9:22) ja KML:n mahdollisuutta.
Tutkittavan näytteen BCR-ABL1-transkriptin mittaaminen kvantitatiivisen RT-PCR:n avulla perustuu BCR-ABL1 / ABL1 (%) suhteen raportointiin kansainvälisellä IS (International Scale) -asteikolla. Referenssigeeninä käytetään ABL1-kontrolligeeniä, johon patologisen fuusiogeenin lähetti-RNA:n määrä ensin suhteutetaan. Riittävän korkea ABL1-kopioluku kertoo ajon onnistumisesta ja on edellytys tuloksen tulkinnalle.
Tuloksesta annetaan lausunto. Diagnoosivaiheen näytteen lausunnossa havaitaan / ei havaita BCR-ABL1 (major) fuusiotranskriptia. Seurantanäytteen lausunnossa ilmoitetaan jäännöstaudin prosentuaalinen osuus IS-asteikolla ja molekulaarisen vasteen syvyyttä kuvaava MR (molecular response) -luokka.
MR-luokat: MMR (major molecular response) eli merkittävä molekulaarinen vaste: - Jäännöstaudin osuus IS-asteikolla korkeintaan 0,1 % - ABL1-kopioluku vähintään 10 000
MR4 (deep molecular response) eli syvä molekulaarinen vaste: - Jäännöstaudin osuus IS-asteikolla ei mitattavissa tai korkeintaan 0,01 % - ABL1-kopioluku vähintään 10 000
MR4.5 (deep molecular response) eli syvä molekulaarinen vaste: - Jäännöstaudin osuus IS-asteikolla ei mitattavissa tai korkeintaan 0,0032 % - ABL1-kopioluku vähintään 32 000
MR5 (deep molecular response) eli syvä molekulaarinen vaste: - Jäännöstaudin osuus IS-asteikolla ei mitattavissa - ABL1-kopioluku vähintään 100 000
Tulkinta
VASTAUS: Tutkimuksesta annetaan lausunto.
Huomautuksia
Vastauskäytäntö muuttunut 21.11.2023 alkaen. Aiemmin käytössä ollut EAC-protokollaan perustunut menetelmä ei raportoinut tulosta IS-asteikolla. Tämän vuoksi tuloksissa voi esiintyä eroavaisuutta verrattuna nykymenetelmään.
Päivitetty 20.11.2023 / SK