 |
Tutkimusohjekirjan etusivu. Hakemisto erikoisalan, nimen, lyhenteen tai tutkimusnumeron mukaan
Fragiili-X, DNA-tutkimus, kudosnäytteestä
| 4306 | Ts-FraX-D |
Tiedustelut
Genetiikan laboratorio, puh. 040 6356318 tai 040 6356302
Asiantuntijat
sairaalageneetikko Marja-Leena Väisänen: marja-leena.vaisanen
nordlab.fi / 040-635 6302
Indikaatiot
Riskiraskaudet, kun suvussa/perheessä tiedetään esiintyvän fragiili X oireyhtymää tai kun vanhempien kantajuus tiedetään.
Suoritus
FMR1-geenin CGG-trinukleotiditoistojakson RP-PCR (repeat primed) ja koon määritys fragmenttianalyysillä. Tarvittaessa ekspansion metylaatiostatuksen määritys mPCR:lla. Tutkimus tehdään kaupallisilla IVD/CE merkityillä kiteillä (AmplideX FMR1 PCR ja mPCR kitit, Asuragen). Akkreditoitu menetelmä.
Näyte
NÄYTE: Istukkabiopsianäyte, n. 20-30 mg. OYS:n ulkopuolella otettu istukkanäyte suositellaan toimitettavaksi eristettynä DNA:na. Näytteen mukaan liitetään Genetiikan laboratorion lähete, jonka saa laboratorion kotisivuilta (www.nordlab.fi ja sieltä valitsemalla Lähetteet/Genetiikan laboratorio, NordLab Oulu).
LÄHETYS: OYS:ssa otettu näyte lähetetään välittömästi genetiikan laboratorioon (S6E 1. krs). OYS:n ulkopuolella otettu näyte pakataan huolellisesti ja lähetetään pika- tai ykköspostissa osoitteeseen: NordLab Oulu, Genetiikan laboratorio, PL 500, 90029 OYS.
Menetelmä
FMR1-geenin CGG-trinukleotiditoistojakson RP-PCR (repeat primed) ja koon määritys fragmenttianalyysillä. Tarvittaessa ekspansion metylaatiostatuksen määritys mPCR:lla. Tutkimus tehdään kaupallisilla IVD/CE merkityillä kiteillä (AmplideX FMR1 PCR ja mPCR kitit, Asuragen).
Tekotiheys
Arkipäivisin, tutkimus valmistuu 3-5 vrk:ssa.
Tulokset valmiina
Viikon kuluessa näytteen saapumisesta.
Yleistä
Fragiili-X-oireyhtymä on yleisin tunnettu perinnöllinen kehitysvammaisuuden syy. Oireyhtymä ilmenee kehityksen viivästymisenä/kehitysvammaisuutena ja usein puheenkehityksen häiriöinä. Siihen liittyy tyypilliset dysmorfiset kasvonpiirteet (pitkänomaiset kasvot, korkea otsa, isot korvat)ja makro-orkidismi. Fragiili-X-oireyhtymä aiheutuu kromosomialueella Xq27.3 (FRAXA) sijaitsevan FMR1-geenin 5'-alueen CGG-toistojakson laajenemisesta, joka saa aikaan geenin inaktivoitumisen. Toistojaksojen lukumäärä on normaalisti <50 ja alue pysyy stabiilina periytyessään. Esimutaatiossa toistojaksojen määrä on >55-200 ja sen kantajat ovat kliinisesti terveitä. Esimutaation kantajanaisilla on kuitenkin todettu kohonnut riski ennenaikaiseen munasarjojen toiminnan hiipumiseen (premature ovarian insufficiency, FXPOI). Lisäksi iäkkäillä kantajamiehillä on raportoitu tremor- ja ataksiatyyppisiä oireita (FXTAS). Näiden kantajamanifestaatioiden patofysiologiaa ei täysin tiedetä. Esimutaatio saa aikaan alueen epästabiilisuuden meioosissa, jolloin sen koko kasvaa periytyessä. Normaalialueen ja esimutaatioalueen väliin jäävällä ns. harmaalla alueella (n. 45-54 CGG-toistoa) saattaa joissain perheissä jo esiintyä CGG-toistojaksoalueen epästabiilisuutta. Täysmutaatioiksi luokitellaan yli 200 toistojakson laajentumat, joihin liittyy geenin 5' -pään hypermetyloituminen eli geenin inaktivoituminen. Täysmutaatiot ovat epästabilleja sekä mitoosissa että meioosissa. Pojilla/miehillä täysmutaatio johtaa fragiili-X-oireyhtymän kliiniseen ilmenemiseen, tytöillä/naisilla noin 50-60%:ssa tapauksista ja fenotyyppi on vaihtelevampi. Toistojaksomutaatiot ovat ylivoimaisesti yleisin oireyhtymään johtava muutos (n. 99%:a tapauksista). Myös deleetioita tai pistemutaatioita on todettu FMR1-geenin alueella, mutta ne ovat harvinaisia.
Huomautuksia
Sikiödiagnostisista tapauksista on hyvä ilmoittaa ja sopia ennakolta (puh. 040 6356302 tai 040 6356318).
Päivitetty 24.11.2021 / MLV